Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnih4Q9CX13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnih4Q9CX13 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnih4Q9CX13 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnih4Q9CX13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnih4Q9CX13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnih4Q9CX13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnih4Q9CX13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnih4Q9CX13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnih4Q9CX13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnih4Q9CX13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnih4Q9CX13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnih4Q9CX13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnih4Q9CX13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnih4Q9CX13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnih4Q9CX13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnih4Q9CX13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnih4Q9CX13 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms