Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ist1Q9CX00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ist1Q9CX00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ist1Q9CX00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ist1Q9CX00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ist1Q9CX00 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ist1Q9CX00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ist1Q9CX00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ist1Q9CX00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ist1Q9CX00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ist1Q9CX00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ist1Q9CX00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ist1Q9CX00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ist1Q9CX00 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ist1Q9CX00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ist1Q9CX00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ist1Q9CX00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ist1Q9CX00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ist1Q9CX00 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ist1Q9CX00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ist1Q9CX00 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ist1Q9CX00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ist1Q9CX00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ist1Q9CX00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ist1Q9CX00 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ist1Q9CX00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ist1Q9CX00 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ist1Q9CX00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ist1Q9CX00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms