Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lhfpl3Q9CTN8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lhfpl3Q9CTN8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lhfpl3Q9CTN8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lhfpl3Q9CTN8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lhfpl3Q9CTN8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lhfpl3Q9CTN8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lhfpl3Q9CTN8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lhfpl3Q9CTN8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lhfpl3Q9CTN8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.5 ms