Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Gnpda2Q9CRC9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,8■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,77■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Gnpda2Q9CRC9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gnpda2Q9CRC9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Gnpda2Q9CRC9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Gnpda2Q9CRC9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Gnpda2Q9CRC9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Gnpda2Q9CRC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Gnpda2Q9CRC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Gnpda2Q9CRC9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Gnpda2Q9CRC9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Gnpda2Q9CRC9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Gnpda2Q9CRC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Gnpda2Q9CRC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Gnpda2Q9CRC9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,32■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Gnpda2Q9CRC9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Gnpda2Q9CRC9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Gnpda2Q9CRC9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gnpda2Q9CRC9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Gnpda2Q9CRC9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Gnpda2Q9CRC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Gnpda2Q9CRC9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms