Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riok2Q9CQS5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riok2Q9CQS5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Riok2Q9CQS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Riok2Q9CQS5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Riok2Q9CQS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Riok2Q9CQS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Riok2Q9CQS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok2Q9CQS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Riok2Q9CQS5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok2Q9CQS5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Riok2Q9CQS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Riok2Q9CQS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Riok2Q9CQS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Riok2Q9CQS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Riok2Q9CQS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Riok2Q9CQS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms