Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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KRTAP9-4Q9BYQ2 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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