Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim8Q99PJ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim8Q99PJ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim8Q99PJ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim8Q99PJ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim8Q99PJ2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim8Q99PJ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim8Q99PJ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim8Q99PJ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim8Q99PJ2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim8Q99PJ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim8Q99PJ2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim8Q99PJ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim8Q99PJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim8Q99PJ2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim8Q99PJ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim8Q99PJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim8Q99PJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim8Q99PJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim8Q99PJ2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim8Q99PJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim8Q99PJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms