Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab27bQ99P58 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab27bQ99P58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab27bQ99P58 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab27bQ99P58 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab27bQ99P58 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab27bQ99P58 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rab27bQ99P58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab27bQ99P58 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab27bQ99P58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab27bQ99P58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab27bQ99P58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms