Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brms1Q99N20 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Brms1Q99N20 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brms1Q99N20 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Brms1Q99N20 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brms1Q99N20 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Brms1Q99N20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Brms1Q99N20 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brms1Q99N20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Brms1Q99N20 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brms1Q99N20 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Brms1Q99N20 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brms1Q99N20 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brms1Q99N20 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Brms1Q99N20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brms1Q99N20 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brms1Q99N20 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brms1Q99N20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brms1Q99N20 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brms1Q99N20 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brms1Q99N20 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Brms1Q99N20 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brms1Q99N20 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brms1Q99N20 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brms1Q99N20 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Brms1Q99N20 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Brms1Q99N20 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brms1Q99N20 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Brms1Q99N20 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Brms1Q99N20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Brms1Q99N20 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Brms1Q99N20 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms