Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msh4Q99MT2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msh4Q99MT2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh4Q99MT2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh4Q99MT2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Msh4Q99MT2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh4Q99MT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh4Q99MT2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msh4Q99MT2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Msh4Q99MT2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msh4Q99MT2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msh4Q99MT2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Msh4Q99MT2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msh4Q99MT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msh4Q99MT2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msh4Q99MT2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msh4Q99MT2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msh4Q99MT2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh4Q99MT2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msh4Q99MT2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msh4Q99MT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms