Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkd1Q99MH6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkd1Q99MH6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkd1Q99MH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkd1Q99MH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkd1Q99MH6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkd1Q99MH6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkd1Q99MH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkd1Q99MH6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkd1Q99MH6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nkd1Q99MH6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkd1Q99MH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkd1Q99MH6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkd1Q99MH6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkd1Q99MH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkd1Q99MH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkd1Q99MH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nkd1Q99MH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkd1Q99MH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms