Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chmp1b1Q99LU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chmp1b1Q99LU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chmp1b1Q99LU0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp1b1Q99LU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chmp1b1Q99LU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp1b1Q99LU0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp1b1Q99LU0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp1b1Q99LU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp1b1Q99LU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp1b1Q99LU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp1b1Q99LU0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp1b1Q99LU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp1b1Q99LU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp1b1Q99LU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp1b1Q99LU0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp1b1Q99LU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chmp1b1Q99LU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp1b1Q99LU0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp1b1Q99LU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp1b1Q99LU0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp1b1Q99LU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms