Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rnf34Q99KR6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rnf34Q99KR6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rnf34Q99KR6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Rnf34Q99KR6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rnf34Q99KR6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Rnf34Q99KR6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Rnf34Q99KR6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Rnf34Q99KR6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Rnf34Q99KR6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rnf34Q99KR6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rnf34Q99KR6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Rnf34Q99KR6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Rnf34Q99KR6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Rnf34Q99KR6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rnf34Q99KR6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Rnf34Q99KR6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rnf34Q99KR6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Rnf34Q99KR6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Rnf34Q99KR6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Rnf34Q99KR6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rnf34Q99KR6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rnf34Q99KR6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rnf34Q99KR6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rnf34Q99KR6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rnf34Q99KR6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Rnf34Q99KR6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rnf34Q99KR6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,9 ms