Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clint1Q99KN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clint1Q99KN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clint1Q99KN9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clint1Q99KN9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clint1Q99KN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clint1Q99KN9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clint1Q99KN9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clint1Q99KN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clint1Q99KN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clint1Q99KN9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clint1Q99KN9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clint1Q99KN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clint1Q99KN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clint1Q99KN9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clint1Q99KN9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clint1Q99KN9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clint1Q99KN9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clint1Q99KN9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clint1Q99KN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clint1Q99KN9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clint1Q99KN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clint1Q99KN9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clint1Q99KN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clint1Q99KN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms