Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Eif3mQ99JX4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3mQ99JX4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3mQ99JX4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3mQ99JX4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3mQ99JX4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3mQ99JX4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3mQ99JX4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3mQ99JX4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3mQ99JX4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Eif3mQ99JX4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Eif3mQ99JX4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Eif3mQ99JX4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Eif3mQ99JX4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eif3mQ99JX4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Eif3mQ99JX4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Eif3mQ99JX4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms