Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip2Q99JG7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnip2Q99JG7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnip2Q99JG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip2Q99JG7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnip2Q99JG7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnip2Q99JG7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnip2Q99JG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnip2Q99JG7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnip2Q99JG7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnip2Q99JG7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnip2Q99JG7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnip2Q99JG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip2Q99JG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnip2Q99JG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnip2Q99JG7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms