Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tspan1Q99J59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tspan1Q99J59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tspan1Q99J59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tspan1Q99J59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tspan1Q99J59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tspan1Q99J59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tspan1Q99J59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tspan1Q99J59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan1Q99J59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tspan1Q99J59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tspan1Q99J59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tspan1Q99J59 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan1Q99J59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tspan1Q99J59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tspan1Q99J59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Tspan1Q99J59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan1Q99J59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan1Q99J59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tspan1Q99J59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tspan1Q99J59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan1Q99J59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tspan1Q99J59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan1Q99J59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tspan1Q99J59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tspan1Q99J59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan1Q99J59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms