Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc8b1Q925Q3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc8b1Q925Q3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc8b1Q925Q3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc8b1Q925Q3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc8b1Q925Q3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc8b1Q925Q3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc8b1Q925Q3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc8b1Q925Q3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc8b1Q925Q3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc8b1Q925Q3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc8b1Q925Q3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc8b1Q925Q3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc8b1Q925Q3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc8b1Q925Q3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slc8b1Q925Q3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc8b1Q925Q3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc8b1Q925Q3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc8b1Q925Q3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc8b1Q925Q3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc8b1Q925Q3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc8b1Q925Q3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc8b1Q925Q3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc8b1Q925Q3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc8b1Q925Q3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms