Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn16Q925N4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn16Q925N4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn16Q925N4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn16Q925N4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn16Q925N4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn16Q925N4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cldn16Q925N4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn16Q925N4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn16Q925N4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn16Q925N4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn16Q925N4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn16Q925N4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn16Q925N4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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