Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf144aQ925F3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf144aQ925F3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf144aQ925F3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf144aQ925F3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf144aQ925F3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf144aQ925F3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf144aQ925F3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf144aQ925F3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf144aQ925F3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf144aQ925F3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf144aQ925F3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf144aQ925F3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf144aQ925F3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf144aQ925F3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf144aQ925F3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf144aQ925F3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf144aQ925F3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf144aQ925F3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf144aQ925F3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms