Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc49Q91YK0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc49Q91YK0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc49Q91YK0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc49Q91YK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc49Q91YK0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc49Q91YK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc49Q91YK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc49Q91YK0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc49Q91YK0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc49Q91YK0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc49Q91YK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc49Q91YK0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc49Q91YK0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc49Q91YK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc49Q91YK0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc49Q91YK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc49Q91YK0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc49Q91YK0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc49Q91YK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc49Q91YK0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc49Q91YK0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc49Q91YK0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc49Q91YK0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc49Q91YK0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc49Q91YK0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms