Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Synpo2Q91YE8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Synpo2Q91YE8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Synpo2Q91YE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Synpo2Q91YE8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Synpo2Q91YE8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Synpo2Q91YE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Synpo2Q91YE8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Synpo2Q91YE8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Synpo2Q91YE8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Synpo2Q91YE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Synpo2Q91YE8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Synpo2Q91YE8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Synpo2Q91YE8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Synpo2Q91YE8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Synpo2Q91YE8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Synpo2Q91YE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Synpo2Q91YE8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Synpo2Q91YE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Synpo2Q91YE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Synpo2Q91YE8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Synpo2Q91YE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Synpo2Q91YE8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Synpo2Q91YE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Synpo2Q91YE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Synpo2Q91YE8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Synpo2Q91YE8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Synpo2Q91YE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Synpo2Q91YE8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Synpo2Q91YE8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Synpo2Q91YE8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Synpo2Q91YE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Synpo2Q91YE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Synpo2Q91YE8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms