Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha8Q91Y12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha8Q91Y12 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha8Q91Y12 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdha8Q91Y12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha8Q91Y12 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha8Q91Y12 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha8Q91Y12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha8Q91Y12 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha8Q91Y12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha8Q91Y12 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha8Q91Y12 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha8Q91Y12 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdha8Q91Y12 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha8Q91Y12 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdha8Q91Y12 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdha8Q91Y12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdha8Q91Y12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdha8Q91Y12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha8Q91Y12 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha8Q91Y12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha8Q91Y12 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha8Q91Y12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha8Q91Y12 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha8Q91Y12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha8Q91Y12 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.7 ms