Protein–RNA interactions for Protein: Q91WV7

Slc3a1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc3a1Q91WV7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc3a1Q91WV7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc3a1Q91WV7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc3a1Q91WV7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc3a1Q91WV7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc3a1Q91WV7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc3a1Q91WV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc3a1Q91WV7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc3a1Q91WV7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc3a1Q91WV7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc3a1Q91WV7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc3a1Q91WV7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc3a1Q91WV7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc3a1Q91WV7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc3a1Q91WV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc3a1Q91WV7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc3a1Q91WV7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc3a1Q91WV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc3a1Q91WV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc3a1Q91WV7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc3a1Q91WV7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc3a1Q91WV7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc3a1Q91WV7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc3a1Q91WV7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc3a1Q91WV7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc3a1Q91WV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc3a1Q91WV7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc3a1Q91WV7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc3a1Q91WV7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc3a1Q91WV7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms