Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA1

Tipin, TIMELESS-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TipinQ91WA1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TipinQ91WA1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TipinQ91WA1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TipinQ91WA1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TipinQ91WA1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TipinQ91WA1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TipinQ91WA1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TipinQ91WA1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TipinQ91WA1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TipinQ91WA1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TipinQ91WA1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TipinQ91WA1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms