Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BsndQ8VIM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BsndQ8VIM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BsndQ8VIM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BsndQ8VIM4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BsndQ8VIM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BsndQ8VIM4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BsndQ8VIM4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BsndQ8VIM4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BsndQ8VIM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BsndQ8VIM4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BsndQ8VIM4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BsndQ8VIM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BsndQ8VIM4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BsndQ8VIM4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BsndQ8VIM4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BsndQ8VIM4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BsndQ8VIM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BsndQ8VIM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BsndQ8VIM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BsndQ8VIM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms