Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc65Q8VHI7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc65Q8VHI7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc65Q8VHI7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc65Q8VHI7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc65Q8VHI7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc65Q8VHI7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc65Q8VHI7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc65Q8VHI7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc65Q8VHI7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc65Q8VHI7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc65Q8VHI7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc65Q8VHI7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc65Q8VHI7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc65Q8VHI7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc65Q8VHI7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc65Q8VHI7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc65Q8VHI7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc65Q8VHI7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc65Q8VHI7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc65Q8VHI7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc65Q8VHI7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc65Q8VHI7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc65Q8VHI7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc65Q8VHI7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc65Q8VHI7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc65Q8VHI7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc65Q8VHI7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc65Q8VHI7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc65Q8VHI7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc65Q8VHI7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc65Q8VHI7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc65Q8VHI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc65Q8VHI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc65Q8VHI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc65Q8VHI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc65Q8VHI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms