Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr6Q8VE11 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mtmr6Q8VE11 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Mtmr6Q8VE11 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mtmr6Q8VE11 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mtmr6Q8VE11 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mtmr6Q8VE11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr6Q8VE11 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mtmr6Q8VE11 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mtmr6Q8VE11 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr6Q8VE11 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr6Q8VE11 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr6Q8VE11 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr6Q8VE11 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr6Q8VE11 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mtmr6Q8VE11 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mtmr6Q8VE11 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mtmr6Q8VE11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mtmr6Q8VE11 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mtmr6Q8VE11 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mtmr6Q8VE11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mtmr6Q8VE11 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mtmr6Q8VE11 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mtmr6Q8VE11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mtmr6Q8VE11 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mtmr6Q8VE11 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms