Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC85

Lsm1, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm1Q8VC85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Lsm1Q8VC85 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Lsm1Q8VC85 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Lsm1Q8VC85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Lsm1Q8VC85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Lsm1Q8VC85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Lsm1Q8VC85 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Lsm1Q8VC85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lsm1Q8VC85 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lsm1Q8VC85 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Lsm1Q8VC85 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Lsm1Q8VC85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,84■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Lsm1Q8VC85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Lsm1Q8VC85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,75■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Lsm1Q8VC85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Lsm1Q8VC85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Lsm1Q8VC85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Lsm1Q8VC85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Lsm1Q8VC85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Lsm1Q8VC85 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lsm1Q8VC85 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
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