Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
TxlnbQ8VBT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
TxlnbQ8VBT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
TxlnbQ8VBT1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
TxlnbQ8VBT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
TxlnbQ8VBT1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,56■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,53■■■□□ 2
TxlnbQ8VBT1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
TxlnbQ8VBT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
TxlnbQ8VBT1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,36■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
TxlnbQ8VBT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
TxlnbQ8VBT1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,25■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
TxlnbQ8VBT1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,15■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
TxlnbQ8VBT1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
TxlnbQ8VBT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
TxlnbQ8VBT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
TxlnbQ8VBT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
TxlnbQ8VBT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
TxlnbQ8VBT1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
TxlnbQ8VBT1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms