Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmx1Q8VBT0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmx1Q8VBT0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmx1Q8VBT0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmx1Q8VBT0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Tmx1Q8VBT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmx1Q8VBT0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tmx1Q8VBT0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmx1Q8VBT0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tmx1Q8VBT0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tmx1Q8VBT0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmx1Q8VBT0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmx1Q8VBT0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmx1Q8VBT0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmx1Q8VBT0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmx1Q8VBT0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tmx1Q8VBT0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmx1Q8VBT0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmx1Q8VBT0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tmx1Q8VBT0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmx1Q8VBT0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmx1Q8VBT0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmx1Q8VBT0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms