Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Prpsap2Q8R574 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prpsap2Q8R574 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Prpsap2Q8R574 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prpsap2Q8R574 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prpsap2Q8R574 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpsap2Q8R574 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prpsap2Q8R574 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prpsap2Q8R574 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prpsap2Q8R574 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Prpsap2Q8R574 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prpsap2Q8R574 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prpsap2Q8R574 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prpsap2Q8R574 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prpsap2Q8R574 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prpsap2Q8R574 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prpsap2Q8R574 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Prpsap2Q8R574 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prpsap2Q8R574 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prpsap2Q8R574 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prpsap2Q8R574 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prpsap2Q8R574 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prpsap2Q8R574 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Prpsap2Q8R574 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prpsap2Q8R574 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prpsap2Q8R574 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prpsap2Q8R574 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prpsap2Q8R574 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prpsap2Q8R574 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prpsap2Q8R574 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prpsap2Q8R574 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prpsap2Q8R574 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prpsap2Q8R574 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpsap2Q8R574 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpsap2Q8R574 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prpsap2Q8R574 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 331.6 ms