Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D6

Vmn1r24, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r24Q8R2D6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r24Q8R2D6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vmn1r24Q8R2D6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r24Q8R2D6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r24Q8R2D6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vmn1r24Q8R2D6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vmn1r24Q8R2D6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vmn1r24Q8R2D6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r24Q8R2D6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn1r24Q8R2D6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn1r24Q8R2D6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r24Q8R2D6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn1r24Q8R2D6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vmn1r24Q8R2D6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vmn1r24Q8R2D6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn1r24Q8R2D6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vmn1r24Q8R2D6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r24Q8R2D6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn1r24Q8R2D6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r24Q8R2D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r24Q8R2D6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r24Q8R2D6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn1r24Q8R2D6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r24Q8R2D6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r24Q8R2D6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r24Q8R2D6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r24Q8R2D6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r24Q8R2D6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms