Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc5Q8K4Z2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc5Q8K4Z2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc5Q8K4Z2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc5Q8K4Z2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fndc5Q8K4Z2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc5Q8K4Z2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc5Q8K4Z2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc5Q8K4Z2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc5Q8K4Z2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc5Q8K4Z2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fndc5Q8K4Z2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fndc5Q8K4Z2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fndc5Q8K4Z2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc5Q8K4Z2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fndc5Q8K4Z2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fndc5Q8K4Z2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc5Q8K4Z2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fndc5Q8K4Z2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms