Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PolbQ8K409 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PolbQ8K409 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PolbQ8K409 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PolbQ8K409 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PolbQ8K409 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PolbQ8K409 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PolbQ8K409 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PolbQ8K409 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PolbQ8K409 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PolbQ8K409 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PolbQ8K409 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PolbQ8K409 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PolbQ8K409 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PolbQ8K409 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PolbQ8K409 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PolbQ8K409 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PolbQ8K409 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PolbQ8K409 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PolbQ8K409 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PolbQ8K409 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PolbQ8K409 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PolbQ8K409 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms