Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pacs1Q8K212 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pacs1Q8K212 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacs1Q8K212 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacs1Q8K212 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pacs1Q8K212 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pacs1Q8K212 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pacs1Q8K212 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pacs1Q8K212 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacs1Q8K212 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pacs1Q8K212 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pacs1Q8K212 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pacs1Q8K212 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pacs1Q8K212 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacs1Q8K212 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pacs1Q8K212 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pacs1Q8K212 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pacs1Q8K212 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pacs1Q8K212 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pacs1Q8K212 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Pacs1Q8K212 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pacs1Q8K212 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pacs1Q8K212 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pacs1Q8K212 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacs1Q8K212 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms