Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pkn3Q8K045 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Pkn3Q8K045 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pkn3Q8K045 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pkn3Q8K045 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pkn3Q8K045 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pkn3Q8K045 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkn3Q8K045 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkn3Q8K045 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkn3Q8K045 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkn3Q8K045 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkn3Q8K045 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkn3Q8K045 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkn3Q8K045 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkn3Q8K045 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkn3Q8K045 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkn3Q8K045 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkn3Q8K045 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkn3Q8K045 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkn3Q8K045 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkn3Q8K045 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkn3Q8K045 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkn3Q8K045 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn3Q8K045 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkn3Q8K045 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms