Protein–RNA interactions for Protein: Q8K015

Cenpo, Centromere protein O, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpoQ8K015 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpoQ8K015 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpoQ8K015 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpoQ8K015 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpoQ8K015 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpoQ8K015 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpoQ8K015 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpoQ8K015 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CenpoQ8K015 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CenpoQ8K015 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CenpoQ8K015 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CenpoQ8K015 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CenpoQ8K015 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CenpoQ8K015 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpoQ8K015 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpoQ8K015 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CenpoQ8K015 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms