Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps50Q8CI71 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps50Q8CI71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps50Q8CI71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps50Q8CI71 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps50Q8CI71 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vps50Q8CI71 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps50Q8CI71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps50Q8CI71 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps50Q8CI71 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps50Q8CI71 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps50Q8CI71 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps50Q8CI71 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps50Q8CI71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps50Q8CI71 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps50Q8CI71 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms