Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifnl3Q8CGK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifnl3Q8CGK6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnl3Q8CGK6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifnl3Q8CGK6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnl3Q8CGK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifnl3Q8CGK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifnl3Q8CGK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifnl3Q8CGK6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifnl3Q8CGK6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifnl3Q8CGK6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnl3Q8CGK6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifnl3Q8CGK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifnl3Q8CGK6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifnl3Q8CGK6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifnl3Q8CGK6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnl3Q8CGK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifnl3Q8CGK6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ifnl3Q8CGK6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifnl3Q8CGK6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifnl3Q8CGK6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifnl3Q8CGK6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifnl3Q8CGK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifnl3Q8CGK6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ifnl3Q8CGK6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifnl3Q8CGK6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnl3Q8CGK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ifnl3Q8CGK6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms