Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG4

Dmrta1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor A1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dmrta1Q8CFG4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dmrta1Q8CFG4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dmrta1Q8CFG4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dmrta1Q8CFG4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dmrta1Q8CFG4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dmrta1Q8CFG4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dmrta1Q8CFG4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dmrta1Q8CFG4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dmrta1Q8CFG4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dmrta1Q8CFG4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dmrta1Q8CFG4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dmrta1Q8CFG4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dmrta1Q8CFG4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dmrta1Q8CFG4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dmrta1Q8CFG4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dmrta1Q8CFG4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms