Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vcpip1Q8CDG3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vcpip1Q8CDG3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Vcpip1Q8CDG3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vcpip1Q8CDG3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vcpip1Q8CDG3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vcpip1Q8CDG3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Vcpip1Q8CDG3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vcpip1Q8CDG3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcpip1Q8CDG3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vcpip1Q8CDG3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vcpip1Q8CDG3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vcpip1Q8CDG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vcpip1Q8CDG3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vcpip1Q8CDG3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vcpip1Q8CDG3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vcpip1Q8CDG3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vcpip1Q8CDG3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vcpip1Q8CDG3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vcpip1Q8CDG3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vcpip1Q8CDG3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vcpip1Q8CDG3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Vcpip1Q8CDG3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vcpip1Q8CDG3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Vcpip1Q8CDG3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms