Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube3dQ8BX13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube3dQ8BX13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3dQ8BX13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ube3dQ8BX13 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube3dQ8BX13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3dQ8BX13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3dQ8BX13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube3dQ8BX13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube3dQ8BX13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube3dQ8BX13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube3dQ8BX13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube3dQ8BX13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3dQ8BX13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3dQ8BX13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube3dQ8BX13 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube3dQ8BX13 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube3dQ8BX13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3dQ8BX13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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