Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifi44Q8BV66 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifi44Q8BV66 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifi44Q8BV66 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifi44Q8BV66 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifi44Q8BV66 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifi44Q8BV66 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi44Q8BV66 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi44Q8BV66 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi44Q8BV66 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi44Q8BV66 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi44Q8BV66 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi44Q8BV66 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi44Q8BV66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ifi44Q8BV66 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifi44Q8BV66 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifi44Q8BV66 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi44Q8BV66 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi44Q8BV66 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi44Q8BV66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifi44Q8BV66 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms