Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia2Q8BSS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia2Q8BSS9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia2Q8BSS9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia2Q8BSS9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia2Q8BSS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfia2Q8BSS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfia2Q8BSS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfia2Q8BSS9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia2Q8BSS9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfia2Q8BSS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia2Q8BSS9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia2Q8BSS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfia2Q8BSS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia2Q8BSS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfia2Q8BSS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ppfia2Q8BSS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ppfia2Q8BSS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ppfia2Q8BSS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfia2Q8BSS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms