Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Gga3Q8BMI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gga3Q8BMI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Gga3Q8BMI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Gga3Q8BMI3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gga3Q8BMI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Gga3Q8BMI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Gga3Q8BMI3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Gga3Q8BMI3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,91■■■□□ 2,38
Gga3Q8BMI3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Gga3Q8BMI3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gga3Q8BMI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Gga3Q8BMI3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Gga3Q8BMI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Gga3Q8BMI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Gga3Q8BMI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gga3Q8BMI3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Gga3Q8BMI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Gga3Q8BMI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Gga3Q8BMI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Gga3Q8BMI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Gga3Q8BMI3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Gga3Q8BMI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Gga3Q8BMI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Gga3Q8BMI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Gga3Q8BMI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Gga3Q8BMI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Gga3Q8BMI3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gga3Q8BMI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Gga3Q8BMI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gga3Q8BMI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Gga3Q8BMI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gga3Q8BMI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Gga3Q8BMI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Gga3Q8BMI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Gga3Q8BMI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Gga3Q8BMI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms