Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tubgcp5Q8BKN5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tubgcp5Q8BKN5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp5Q8BKN5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tubgcp5Q8BKN5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tubgcp5Q8BKN5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp5Q8BKN5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tubgcp5Q8BKN5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tubgcp5Q8BKN5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tubgcp5Q8BKN5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tubgcp5Q8BKN5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tubgcp5Q8BKN5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tubgcp5Q8BKN5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tubgcp5Q8BKN5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp5Q8BKN5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tubgcp5Q8BKN5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms