Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nup107Q8BH74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup107Q8BH74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup107Q8BH74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup107Q8BH74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup107Q8BH74 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup107Q8BH74 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup107Q8BH74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup107Q8BH74 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup107Q8BH74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup107Q8BH74 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup107Q8BH74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup107Q8BH74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nup107Q8BH74 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nup107Q8BH74 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nup107Q8BH74 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nup107Q8BH74 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup107Q8BH74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup107Q8BH74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms