Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM7

Prkag3, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag3Q8BGM7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Prkag3Q8BGM7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Prkag3Q8BGM7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Prkag3Q8BGM7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Prkag3Q8BGM7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Prkag3Q8BGM7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Prkag3Q8BGM7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Prkag3Q8BGM7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Prkag3Q8BGM7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Prkag3Q8BGM7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Prkag3Q8BGM7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Prkag3Q8BGM7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Prkag3Q8BGM7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Prkag3Q8BGM7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,37
Prkag3Q8BGM7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Prkag3Q8BGM7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Prkag3Q8BGM7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Prkag3Q8BGM7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Prkag3Q8BGM7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Prkag3Q8BGM7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Prkag3Q8BGM7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,64■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Prkag3Q8BGM7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prkag3Q8BGM7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Prkag3Q8BGM7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Prkag3Q8BGM7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Prkag3Q8BGM7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Prkag3Q8BGM7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Prkag3Q8BGM7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Prkag3Q8BGM7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Prkag3Q8BGM7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Prkag3Q8BGM7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Prkag3Q8BGM7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Prkag3Q8BGM7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Prkag3Q8BGM7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Prkag3Q8BGM7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Prkag3Q8BGM7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Prkag3Q8BGM7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,5 ms