Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Trim6Q8BGE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Trim6Q8BGE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Trim6Q8BGE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Trim6Q8BGE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Trim6Q8BGE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,39■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Trim6Q8BGE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Trim6Q8BGE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Trim6Q8BGE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Trim6Q8BGE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Trim6Q8BGE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Trim6Q8BGE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Trim6Q8BGE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Trim6Q8BGE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Trim6Q8BGE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trim6Q8BGE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Trim6Q8BGE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Trim6Q8BGE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Trim6Q8BGE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Trim6Q8BGE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Trim6Q8BGE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Trim6Q8BGE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Trim6Q8BGE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Trim6Q8BGE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Trim6Q8BGE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Trim6Q8BGE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Trim6Q8BGE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Trim6Q8BGE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Trim6Q8BGE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
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