Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim6Q8BGE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim6Q8BGE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim6Q8BGE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim6Q8BGE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trim6Q8BGE7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim6Q8BGE7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim6Q8BGE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim6Q8BGE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim6Q8BGE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim6Q8BGE7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim6Q8BGE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim6Q8BGE7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim6Q8BGE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim6Q8BGE7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim6Q8BGE7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim6Q8BGE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim6Q8BGE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim6Q8BGE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim6Q8BGE7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim6Q8BGE7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim6Q8BGE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim6Q8BGE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim6Q8BGE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim6Q8BGE7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim6Q8BGE7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim6Q8BGE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim6Q8BGE7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim6Q8BGE7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim6Q8BGE7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms